Упрощённая система налогообложения (УСН) – один из самых популярных налоговых режимов для малого и среднего бизнеса в России. После первого года применения у предпринимателя часто возникают вопросы, связанные с сохранением права на режим, возможными налоговыми проверками и особенностями расчёта НДС. В статье мы разберём, какие требования предъявляются к налогоплательщикам во второй год применения УСН, какие риски могут возникнуть при проверке и как правильно оформить налоговые вычеты.

Кратко о том, что такое УСН

УСН позволяет уплачивать один налог вместо нескольких (НДС, налог на прибыль, налог на имущество). Существует два основных вида УСН:

• УСН «Доходы» – ставка 6 % от всех полученных доходов.
• УСН «Доходы минус расходы» – ставка 15 % от разницы между доходами и подтверждёнными расходами.

Для перехода на УСН необходимо соответствовать ряду критериев (выручка не более 200 млн руб., количество работников ≤ 100, отсутствие отдельных видов деятельности и т.д.). После первого года применения налогоплательщик обязан подтвердить, что сохраняет эти условия.

Переход на второй год применения УСН: что нужно знать

Условия сохранения права на режим

Согласно Налоговому кодексу РФ, право на применение УСН сохраняется, если в течение года не нарушены ключевые ограничения:

1. Годовая выручка не превышает установленный порог.
2. Количественный состав работников и среднесписочная численность не превышают лимитов.
3. Не ведётся деятельность, исключённая из УСН (например, банковская, страховая, игорный бизнес).
4. Не изменился статус юридического лица (например, переход в группу компаний, где более 50 % уставного капитала принадлежит крупному предприятию).

Сроки и порядок уведомления

Налогоплательщик обязан в течение месяца после начала нового налогового периода подать в налоговый орган уведомление о намерении продолжать применение УСН. Если уведомление не подано, налоговая инспекция может признать, что право на УСН утрачено.

Важно помнить, что с 1 января 2025 года при утрате права на УСН повторно перейти на этот режим можно не ранее, чем через год (пункт 1 статьи 346.25 НК РФ).

Налоговые проверки во второй год применения УСН

Причины, по которым инспекция может инициировать проверку

• Несоответствие заявленным доходам и расходам (различия в бухгалтерском и налоговом учёте).
• Подозрения в недостоверных документах (фальсификация актов, накладных, договоров).
• Переход на общий режим налогообложения без надлежащего оформления.
• Получение жалоб от контрагентов или сведения о двойном налогообложении.

Что проверяют налоговики

Во время проверки инспекторы обычно изучают:

1. Книгу учёта доходов и расходов (для УСН «Доходы минус расходы»).
2. Документы, подтверждающие расходы (акты выполненных работ, счета‑фактуры, договоры).
3. Счета‑фактуры и расчётные документы по НДС, если предприниматель приобретал товары/услуги, которые могут быть отнесены к облагаемой НДС‑деятельности.
4. Уведомления о переходе на иной налоговый режим и их сроки.

Как подготовиться к проверке

• Своевременно вести бухгалтерию и хранить оригиналы всех первичных документов.
• Проверить, что все операции, связанные с НДС, правильно отражены в декларациях (см. п. 6 ст. 346.25 НК, письмо Минфина от  № 03‑07‑15/126726).
• Подготовить расчётные листы по ставкам 5/105, 7/107, 20/120, 10/110 (п. 16 письма ФНС от  СД‑4‑3/11815) – они понадобятся, если потребуется выделить НДС из цены договора.
• Сформировать копии всех уведомлений о намерении продолжать применение УСН.

Вопросы, связанные с НДС при УСН

Хотя УСН освобождает от уплаты НДС, налогоплательщик, применяющий этот режим, всё равно может сталкиваться с НДС‑вопросами, особенно при покупке товаров, работ или услуг, которые впоследствии будут использоваться в облагаемой НДС‑деятельности.

Вычет входного НДС

Согласно пунктам 1‑3 ст. 346.16 НК РФ и пунктам 1‑2 ст. 346.17 НК РФ, налогоплательщик, применяющий УСН, имеет право на вычет входного НДС, если:

• Товары, работы или услуги использованы в деятельности, облагаемой НДС после перехода на общий режим.
• Счета‑фактуры оформлены надлежащим образом и отражены в учётных документах.

Важно: дата принятия товаров к учёту не имеет значения (п. 6 ст. 346.25 НК, письмо Минфина от  № 03‑07‑15/126726). Поэтому даже если товар был приобретён в период применения УСН, его можно включить в вычет при переходе на ОСНО.

Как оформить вычет при переходе на ОСНО

1. Подготовить перечень всех приобретений, подлежащих вычету, с указанием даты, суммы НДС и основания использования.
2. Заполнить декларацию по НДС за последний квартал применения УСН, указав в ней «выделение НДС из цены договора» по расчётным ставкам (5/105, 7/107 и т.д.);
3. Подать уточнённую декларацию в ФНС в течение 30 дней после перехода на ОСНО.
4. Сохранить все подтверждающие документы (договоры, акты, счета‑фактуры) – они могут потребоваться в случае проверки.

Судебная практика

В решениях Верховного Суда РФ (Обзор судебной практики № 3 (2021)) подтверждено, что налогоплательщик может отстоять право на вычет НДС даже в случае, если товары не использовались до момента перехода на ОСНО. При этом суд учитывает позиции, изложенные в письмах ФНС от и (БВ‑4‑7/8573).

Судебные и нормативные документы, которые стоит знать

• Письмо Минфина от  № 03‑07‑15/126726 – разъяснение п. 6 ст. 346.25 НК о дате принятия товаров к учёту.
• Письмо ФНС от  СД‑4‑3/11815 – методика выделения НДС из цены договора (ставки 5/105, 7/107, 20/120, 10/110).
• Письмо ФНС от  БВ‑4‑7/8573 – обзор правовых позиций, отражённых в судебных актах Конституционного и Верховного судов.
• Обзор судебной практики Верховного Суда РФ № 3 (2021) – подтверждение права на вычет НДС при переходе с УСН на ОСНО.
• Статья 346.25 НК РФ – порядок перехода к общему режиму налогообложения и учёт НДС.

Как минимизировать риски при налоговой проверке

• Вести бухгалтерию в электронном виде и регулярно делать резервные копии.
• Контролировать сроки подачи уведомлений о продолжении применения УСН.
• Проверять корректность расчёта налоговой базы (особенно при УСН «Доходы минус расходы»).
• Своевременно оформлять и хранить все договоры, акты выполненных работ и счета‑фактуры.
• При переходе на ОСНО подготовить пакет документов для вычета входного НДС и подать уточнённую декларацию в срок.
• Проводить внутренний аудит перед плановой проверкой: сверить данные бухгалтерии с налоговой декларацией.

Что делать, если в ходе проверки выявлены нарушения

1. Составить акт проверки и внимательно изучить замечания инспектора.
2. Если замечания необоснованны, подготовить пояснительные записки и собрать дополнительные документы (копии договоров, подтверждения оплаты и т.д.).
3. В случае подтверждения ошибок – подать уточнённую декларацию и уплатить недоимку, пени и штрафы в установленный срок.
4. Если налогоплательщик не согласен с решением, он имеет право подать жалобу в налоговый орган в течение 30 дней, а затем – обжаловать в суде (в соответствии с Кодексом административного судопроизводства).
5. При необходимости привлечь налогового консультанта или адвоката, специализирующегося на налоговых спорах.

Второй год применения УСН – критический период, когда налогоплательщик должен подтвердить соблюдение всех условий режима, подготовиться к возможным проверкам и правильно оформить вопросы, связанные с НДС. Своевременное уведомление, аккуратный учёт документов и знание актуальной нормативной базы (письма Минфина и ФНС, судебная практика) позволяют избежать штрафов и сохранить право на упрощённый режим.

Помните, что правильная подготовка к проверке и грамотное оформление вычетов НДС – это не только способ избежать финансовых потерь, но и возможность защитить свои интересы в случае спора с налоговыми органами.

Если у вас остались вопросы по применению УСН во второй год, подготовке к проверке или оформлению НДС‑вычетов, рекомендуем обратиться к квалифицированному налоговому консультанту.